“你好，这里是大辻侦探社。”烟雾缭绕间的朦胧幻梦，街巷里逸散的妖异传言……此刻，侦探庄太郎将要直面令世人费解的集团失踪疑案。没有目击者，作案意图不明，而犯罪现场必定出现的“诡异车辙”，其真相究竟是……为了寻求线索，侦探潜入城市的地下领域“昏黑地”。与穿行其间的钢铁装甲列车、及其指挥官丹音的相遇，将为侦探的命运带来巨震……！！

宇宙からの飛来物により廃墟と化した神保町。暴力だけが支配するこの町を統べる花園ゆりねを討つため、星に導かれて南に向かう邪神ちゃん。自然豊かな阿蘇山脈のふもとにある高森町で出会ったのは……。